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進階代謝體學實驗

課程資訊
學年/學期 112/2
授課教師 鄭美玲
開課單位 生醫所博士班
年級-班別 1-甲
科目代號(學分) BMD520(1)
課程名稱 進階代謝體學實驗
開課序號 61400
主要開課序號
修課學生 本校: 5人;外校: 0人
人數限制 0~60
上課時間地點
星期 開始 / 結束 教室 [代碼說明]
星期二 3 (10:10) ~ 4 (12:00) 每週上課
核心能力 按此查詢
備註 5F健康老化中心會議室
教學大綱
教科書 自編教材,以專業論文與書籍為主要內容。
教科書ISBN 0000000000
參考書
課程講義網址
整體教學目標 本課程主要培養生物醫學背景學生具備執行及分析代謝體學實驗與數據基本學理知識,進而可以很快銜接代謝體學實驗內容,已達培養代謝體學實驗檢測與數據分析人才。
教學方法 代謝體學檢測儀器及數據分析操作,使學員能循序漸進地針對核磁共振儀及質譜儀的操作及應用深入淺出的瞭解,已使學員能在實驗前有充足的學理及操作技術知識。
課程簡介 代謝體學是後基因體世代的新興領域,主要關注於低分子量代謝產物於生物系統的全面表徵。做為基因表現的下游,代謝體學與轉錄體學和蛋白質體學之間具互補性,並更密切地反映細胞的活動狀態。由代謝體學研究所獲得的資訊,能提供全面性在正常生理和病理生理狀態之間所具有差異之生化途徑及其相互作用。因此,由上向下的信息可以檢測疾病的進程,對治療的反應,鑑定新的疾病標誌,以及應用於藥物開發。從全譜型代謝物表現到目標代謝物的鑑定和定量,研究方法可提供生物標誌的組合來描述疾病進程間多項危險因子的相互作用。近期許多的營養和生活方式的研究仰賴於代謝體學做為一關鍵平台技術,且代謝體學在個人化醫療也提供了有效的研究方法,產生重要的影響。本課程(1學分)將涵蓋代謝體學研究技術平台設備操作。課程內容將介紹代謝體學技術平台設備與數據分析,以及在基礎研究和臨床醫學上技術平台的應用,例如核磁共振光譜儀、液相層析質譜儀、質譜影像等。學生將於課後獲得生物學到代謝體學技術平台相關檢測技術操作能力。
彈性學習 Review and Final Discussion-鄭美玲 另約時間與授課老師討論(分機3811)。
成績考核 30% 三次實驗報告 20% 核磁共振儀操作考核 20% 質譜儀操作考核 20% 期末報告 10% 平時成績
師生互動時間 每週三17:00-19:00 分機3811
教學進度
項次 教學主題
1
1.上課方式:實體上課 2.授課內容:NMR-based metaolomic analysis-sample preparation 3.授課教師:駱啓仁
2
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: NMR-based metaolomic analysis- 1D proton spectrum acquisition and data processing 3.授課教師:駱啓仁
3
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: NMR-based metaolomic analysis- 2D heteronuclear spectrum acquisition and metabolites identification 3.授課教師:駱啓仁
4
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: NMR spectrometer operational exam 3.授課教師:駱啓仁
5
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: LCMS-based metaolomic analysis (I)- sample preparation 3.授課教師:鄭美玲
6
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Untargeted LCMS-based metaolomic analysis (II) - TOF-MS operation 3.授課教師:鄭美玲
7
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Untargeted LCMS-based metaolomic analysis (III) - TOF-MS operation 3.授課教師:鄭美玲
8
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Untargeted LCMS-based metaolomic analysis (IV) – metabolites identification 3.授課教師:鄭美玲
9
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Targeted LCMS-based metaolomic analysis (V) –TQ-MS operation 3.授課教師:鄭美玲
10
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Targeted LCMS-based metaolomic analysis (VI) –metabolites quantitative analysis 3.授課教師:鄭美玲
11
1.上課方式:實體上課 2.授課內容:LCMS spectrometer operational exam 3.授課教師:鄭美玲
12
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Software practice for statistical, functional, and integrative analysis of metabolomics data using MetaboAnalyst 3.授課教師:張書瑋
13
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Mass image-based metaolomic analysis (I) – sample preparation 3.授課教師:鄭美玲
14
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Mass image-based metaolomic analysis (II) –operation for mass image 3.授課教師:鄭美玲
15
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Mass image-based metaolomic analysis (III) – data processing for mass image 3.授課教師:鄭美玲
16
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Final examination 3.授課教師:鄭美玲
先修課程
本課程沒有先修課程規定