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蛋白質體學與質譜分析實驗

課程資訊

學年/學期

113/1

授課教師

簡昆鎰

開課單位

生醫所博士班

年級-班別

1-

科目代號(學分)

BMD504(1)

課程名稱

蛋白質體學與質譜分析實驗

開課序號

64115

主要開課序號

修課學生

本校: 7人;外校: 0

人數限制

2~25

上課時間地點

星期

開始 / 結束

教室 [代碼說明]

未指定

0 (00:00) ~ 0 (00:00)

暑假上課

核心能力

按此查詢

備註

7/10~7/17 需與同名講授課程合上

教學大綱

教科書

'Introduction to Proteomics”(2004, Humana Press, Totowa, New Jersey)

教科書ISBN

0000000000

參考書

'Purifying proteins for proteomics”(2004, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York)及現行期刊之相關文獻

課程講義網址

ftp://120.126.1.5/Service/summer/2024

整體教學目標

質譜蛋白質體學近年來已成為研究生物醫學的一大利器,正確的樣品製備方法,與實驗的成功與否息息相關。本實驗課的目的在於配合講授課程,提供實務操作的機會,使學員進一步瞭解進行蛋白體鑑定之基礎流程。使學員了解本技術如何輔助其個別研究之進行。

教學方法

實驗步驟講解與實驗操作

課程簡介

本實驗課程將利用特定蛋白質的專一性抗體,針對細胞萃取液進行免疫沉澱,再以SDS-PAGE分離後,針對蛋白染色之條帶,進行膠體內蛋白質之鑑定。學員可實地進行樣品製備及蛋白質鑑定流程之操作,使學員充分了解樣品製備在質譜數據取得的重要性,以期使各學員能將本技術靈活運用於各自的研究領域中。

彈性學習

彈性學習 提供實驗教學錄影檔以供課後複習,以及實驗結果討論

成績考核

實驗實作與實驗報告

師生互動時間

師生互動時間 每周一13:00-14:00 辦公室: 第一醫學大樓0913室,校內分機: 5971email: kychien@mail.cgu.edu.tw

教學進度

項次

教學主題

1

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(4小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 膠體內蛋白水解-酵素切割-1 In-gel digestion-trypsinization-1 3. 授課教師: 簡昆鎰

2

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(2小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 膠體內蛋白水解-酵素切割-2 In-gel digestion-trypsinization-2 3. 授課教師: 簡昆鎰

3

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(2小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 膠體內蛋白水解-胜肽萃取-1 In-gel digestion-peptide extraction-1 3. 授課教師: 簡昆鎰

4

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(1小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 膠體內蛋白水解-胜肽萃取-2 In-gel digestion-peptide extraction-2 3. 授課教師: 簡昆鎰

5

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(3小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 蛋白質萃取 Protein extraction 3. 授課教師: 簡昆鎰

6

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(2小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 蛋白質定量 Protein quantification 3. 授課教師: 簡昆鎰

7

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(2小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 質譜上機樣品製備 Sample preparation for MS analysis 3. 授課教師: 簡昆鎰

8

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(3小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: MALDI-TOF質譜儀操作示範 Operation and demonstration of MALDI-TOF MS 3. 授課教師: 簡昆鎰

9

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(3小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 質譜數據分析(MALDI-TOF MS)-資料庫比對 Data analysis-Mascot search 3. 授課教師: 簡昆鎰

10

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(3小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: LC-MS/MS質譜儀操作示範 Operation and demonstration of LC-MS/MS 3. 授課教師: 簡昆鎰

11

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(3小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 質譜數據分析(LC-MS/MS)-資料庫比對 Data analysis-Mascot search 3. 授課教師: 簡昆鎰

12

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(4小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 數據整合分析 Integration of mass spectrometric results 3. 授課教師: 簡昆鎰

13

1. 上課方式: 口頭報告與討論(彈性學習/線上討論)(4小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 口頭報告與討論 Oral presentation and discussion 3. 授課教師: 簡昆鎰

先修課程

本課程沒有先修課程規定