課程資訊
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學年/學期 |
113/1 |
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授課教師 |
簡昆鎰 |
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開課單位 |
生醫所博士班 |
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年級-班別 |
1-甲 |
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科目代號(學分) |
BMD505(1) |
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課程名稱 |
質譜定量蛋白質體學 |
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開課序號 |
64116 |
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主要開課序號 |
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修課學生 |
本校: 6人；外校: 0人 |
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人數限制 |
2~40 |
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上課時間地點 |
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核心能力 |
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備註 |
教學大綱
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教科書 |
Quantitative Proteomics: New Developments in Mass Spectrometry (Royal Society of Chemistry, London, UK, 2014) |
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教科書ISBN |
0000000000 |
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參考書 |
近期期刊 |
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課程講義網址 |
ftp://120.126.1.5/Service/summer/2024 |
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整體教學目標 |
蛋白質體學近年來已成為研究生物醫學的一大利器，而其蓬勃發展則與質譜技術的快速演進息息相關，利用質譜進行蛋白質定量可與傳統染色定量法相輔相成。本課程之教學目標在於使學員了解質譜學技術在定量蛋白質體學研究之應用現況，加強對質譜技術之原理，以及各種實驗平台之優缺點的了解。使學員具備將質譜學技術運用於其研究主題的能力。 |
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教學方法 |
實體課堂講授 |
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課程簡介 |
本課程之教學對象為具有質譜經驗的學員，教學目標在於使這些學員進一步了解質譜技術在定量蛋白質體學研究之應用現況，加強對質譜技術之原理，以及各種實驗平台之優缺點的了解。因此，本課程內容著重於對各類型質譜儀之特質及運作原理的講解、定量技術及策略之規劃，穩定同位素標定之種類，及質譜分析及生物資訊分析軟體之介紹。使學員充分了解如何將本技術靈活運用於各自的研究領域中。 |
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彈性學習 |
彈性學習教學/實體或線上上課 |
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成績考核 |
考試與書面報告 |
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師生互動時間 |
師生互動時間 每周一15:00-16:00 辦公室: 第一醫學大樓0913室，校內分機: 5971，email: kychien@mail.cgu.edu.tw |
教學進度
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項次 |
教學主題 |
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1 |
1. 上課方式: 實體上課(1小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 質譜技術應用於定量蛋白質體學之概況 Introduction to quantitative proteomics 3. 授課教師: 簡昆鎰 |
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2 |
1. 上課方式: 實體上課(2小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 液相層析質譜學之原理 Liquid chromatography-mass spectrometry 3. 授課教師: 簡昆鎰 |
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3 |
1. 上課方式: 實體上課(1小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 質譜定量平臺-無標定定量法 Quantitative proteomics–label free 3. 授課教師: 簡昆鎰 |
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4 |
1. 上課方式: 實體上課(2小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 穩定性同位素標定之質譜定量平臺-培養基標定法Stable isotope-coded quantitative proteomics –Stable isotope labeling by amino acids in cell culture 3. 授課教師: 簡昆鎰 |
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5 |
1. 上課方式: 實體上課(2小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 穩定性同位素標定之質譜定量平臺-化學標定法-1 Stable isotope-coded quantitative proteomics – chemical labeling-1 3. 授課教師: 簡昆鎰 |
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6 |
1. 上課方式: 實體上課(2小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 質譜定量軟體 Software for quantitative proteomics 3. 授課教師: 簡昆鎰 |
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7 |
1. 上課方式: 實體上課(2小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 生物資訊軟體 Tools for bioinformatics 3. 授課教師: 簡昆鎰 |
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8 |
1. 上課方式: 實體上課(3小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: OMICS數據叢集分析 Clustering analysis of omics data 3. 授課教師: 李御賢 |
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9 |
1. 上課方式: 實體上課(1小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 穩定性同位素標定之質譜定量平臺-化學標定法-2 Stable isotope-coded quantitative proteomics – chemical labeling-2 3. 授課教師: 簡昆鎰 |
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10 |
1. 上課方式: 彈性學習教學/實體或線上上課(2小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 定量蛋白體學之新穎技術(彈性學習) Advances in quantitative proteomics 3. 授課教師: 簡昆鎰 |
先修課程
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本課程沒有先修課程規定 |