生物醫學研究所

學年/學期

113/1

授課教師

簡昆鎰

開課單位

生醫所博士班

年級-班別

1-甲

科目代號(學分)

BMD506(1)

課程名稱

質譜定量蛋白質體學實驗

開課序號

64117

主要開課序號

修課學生

本校: 6人；外校: 0人

人數限制

2~20

上課時間地點

核心能力

按此查詢

備註

需與同名講授課程合上

教科書

Quantitative Proteomics: New Developments in Mass Spectrometry (Royal Society of Chemistry, London, UK, 2014)

教科書ISBN

0000000000

參考書

近期期刊

課程講義網址

ftp://120.126.1.5/Service/summer/2024

整體教學目標

質譜定量蛋白質體學近年來已成為研究生物醫學的一大利器，選擇適當的蛋白質體定量策略及正確的樣品製備方法，與實驗的成功與否息息相關。本實驗課的目的在於配合講授課程，提供實務操作的機會，使學員進一步瞭解進行蛋白體定量分析的實驗規劃及操作流程之注意事項。使學員具備將本技術運用於其研究主題的能力。

教學方法

實驗步驟講解與實際操作

課程簡介

本課程將利用特定蛋白質的專一性抗體，針對細胞萃取液進行免疫沉澱，再以穩定同位素標定結合質譜技術(液相層析質譜學)的蛋白質定量方法，找尋特定蛋白質之交互作用蛋白。學員如有特別感興趣的目標蛋白，亦可自行準備抗體，作為實作課程的材料。主要實驗規劃為實地進行樣品製備及蛋白質鑑定與定量流程之操作，使學員充分了解樣品製備在質譜數據取得的重要性，以期使各學員能將本技術靈活運用於各自的研究領域中。

彈性學習

提供實驗操作教學錄影檔以供課後複習，以及蛋白質體核心實驗室見習

成績考核

實驗實作與實驗報告

師生互動時間

師生互動時間 每周一14:00-15:00 辦公室: 第一醫學大樓0913室，校內分機: 5971，email: kychien@mail.cgu.edu.tw

項次

教學主題

1

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(6小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 免疫沉澱與水解蛋白 Immunoprecipitation and protein digestion 3. 授課教師: 簡昆鎰

2

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(4小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 胜肽標定與樣品淨化 Peptide labeling and sample clean-up 3. 授課教師: 簡昆鎰

3

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(6小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 質譜數據取得 Data acquisition- operation of LC-MS/MS 3. 授課教師: 簡昆鎰

4

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(4小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 質譜定量軟體操作 Operation of quantification software 3. 授課教師: 簡昆鎰

5

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(4小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 生物資訊軟體操作 Data mining using Bioinformatics tools 3. 授課教師: 簡昆鎰

6

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(4小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 質譜定量數據之整合分析 Integration of quantification results 3. 授課教師: 簡昆鎰

7

1. 上課方式: 實體上課/實驗操作(4小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 口頭報告與討論 Oral presentation and discussion 3. 授課教師: 簡昆鎰

8

1. 上課方式: 彈性教學(1小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 彈性教學/蛋白質體核心實驗室操作/見習-1 3. 授課教師: 簡昆鎰

9

1. 上課方式: 彈性教學(1小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 彈性教學/蛋白質體核心實驗室操作/見習-2 3. 授課教師: 簡昆鎰

10

1. 上課方式: 彈性教學(1小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 彈性教學/蛋白質體核心實驗室操作/見習-3 3. 授課教師: 簡昆鎰

11

1. 上課方式: 彈性教學(1小時) 2. 授課主題/學習目標/授課內容: 彈性教學/蛋白質體核心實驗室操作/見習-4 3. 授課教師: 簡昆鎰

本課程沒有先修課程規定