生物醫學研究所

學年/學期

113/1

授課教師

劉軒

開課單位

生醫所博士班

年級-班別

1-甲

科目代號(學分)

BMD507(1)

課程名稱

轉錄體學與數據分析應用

開課序號

64118

主要開課序號

修課學生

本校: 8人；外校: 0人

人數限制

0~60

上課時間地點

核心能力

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備註

教科書

無特定的教科書，教師參考專業文獻資料自編教學講義。

教科書ISBN

0000000000

參考書

無特定的教科書，教師參考專業文獻資料自編教學講義。

課程講義網址

本課程之EL系統

整體教學目標

透過本課程，學生將可學習到轉錄體學的基本原理、次世代定序技術原理與應用，以及數據統合的能力，並將轉錄體學技術平台應用到轉譯醫學研究領域上。

教學方法

教師授課，實例討論及資料庫應用。

課程簡介

人類基因體定序計劃完成後，轉錄體學研究方法成為近代生物醫學研究領域中極重要的一環，它與蛋白質體學及代謝體學，構成後基因體時代基因功能研究與註解的重要方法。轉錄體學由於發展的時間較早，其技術平台與分析方法較成熟，目前廣為應用在研究人類複雜疾病相關之議題。此課程將以轉錄體為中心，深入介紹如何使用不同的轉錄體學的技術策略與生物資訊分析方法，建構疾病的調控及預測模式，加速臨床疾病精準治療策略的開發。此外,本課程也將介紹以轉錄體為主軸，進而發展之單細胞及空間多模組體學之方法 (single-cell and spatial multi-omics technologies , also known as multimodal omics approaches)，深入解析疾病異質特性與細胞間之交互作用。

彈性學習

TEAMS會議線上討論。

成績考核

出席: 20%、書面報告: 80%。

師生互動時間

Friday 3-5 PM Email: liu-hsuan@mail.cgu.edu.tw 分機: 3526

項次

教學主題

1

1. 上課主題：Introduction of Human Transcriptome 2. 授課教師：劉軒 (2hr)

2

1. 上課主題：Technological Development in Transcriptome Analysis 2. 授課教師：劉軒 (2hr)

3

1. 上課主題：Applications of RNA-based Sequencing in Biomedical Research I-Bulk RNA-seq for Coding and Noncoding RNA 2. 授課教師：蘇仕奇 (2hr)

4

1. 上課主題：Transcriptome of Extracellular Vesicles 2. 授課教師：劉軒 (2hr)

5

1. 上課主題：Applications of RNA-based Sequencing in Biomedical Research II- Single-cell and spatial RNA-seq 2. 授課教師：蘇仕奇 (2hr)

6

1. 上課主題：Bulk RNA Sequencing Data Analysis I 2. 授課教師: 張益峯 (2hr)

7

1. 上課主題：Bulk RNA Sequencing Data Analysis II 2. 授課教師: 張益峯 (2hr)

8

1. 上課主題：Single cell RNA Sequencing Data Analysis I 2. 授課教師：劉軒 (2 hr)

9

1. 上課主題：Single cell RNA Sequencing Data Analysis II 2. 授課教師：劉軒 (2 hr)

本課程沒有先修課程規定