101學年度第二學期第一次校院務會議通過新增臨床醫學研究所醫學教育組， 103學年度開始招生，招生分組。
醫學教育研究組設置目的：
• 提升健康照護職場之教育與訓練人員之教育能力。
• 提升醫學教育的理念、水準和國際觀。
• 醫學教育(課程、教學與發展)的研究與成果的推廣。
• 此前瞻性之規劃，可於醫學教育領域取得主導地位，對於日後醫學教育發展具重大影響。
醫學教育組研究特色：
一、培養醫學教育師資與學者。
•擴大培育醫學教育師資
•提升醫學教育學者教學與學術能力
二、東西方教學比較，建立醫學教育本土教學模式。
三、應用數位學習於醫學教育。
四、增進醫學教育研究論文發表之質與量。
畢業相關規定：
1. 畢業學分：必修27學分、選修3學分，畢業學分30學分（不含碩士論文6學分）。碩士論文為必修6學分，於通過學位考試並繳交通過審核論文後給予。
2. 碩士班指導教授需具有醫學教育相關研究所學歷、具部定助理教授級（含）以上之專任教師或長庚醫院具部定助理授級（含）以上之臨床教師。
3. 碩士論文以醫學教育研究為主，並完成以下所列醫學教育相關領域項目其中之一：
A. 國內外學術會議完成發表
B. 國際(SCI)期刊進行投稿
C. 國內評等為優良之期刊進行投稿
4. 醫學教育組英文畢業門檻自107學年度(含)起入學學生適用，訂定如下：
自107學年度(含)起入學學生：
本組研究生須達以下任一英文畢業門檻方能畢業：
(1) 全民英檢中高級初試及格。
(2) 托福500分(含)以上。
(3) 電腦托福173分(含)以上，網路托福61分(含)以上。
(4) 外語能力測驗(FLPT-English) 平均成績65分(含)以上。
(5) IELTS 5級(含)以上。
(6) 多益測驗(TOEIC) 600分(含)以上。
(7) 劍橋伯斯國際職場英語能力測驗(BULATS) 45分(含)以上。
(8) 「專題討論」課程，須至少一學期以全英文報告通過。
5. 其他相關規定請參考各學年度入學適用學生手冊。