本系目前座落於第二醫學大樓五樓。樓層活動空間為480坪。其中設有全國唯一呼吸治療實驗教室共3間, 示範病房1間,階梯教室(90人)1間,討論室3間,教師研究室共9間,電腦與圖書資料室1間, 實驗室共4間,儀器室1間等。