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貴重及共同儀器中心

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關於基因體核酸分析平台

成立緣起

高通量 (High-throughput) 生物實驗技術的快速發展，揭開了後基因體時代 (Post-genomic Era) 的序幕。其中，近十餘年來突破性的次世代定序技術 (Next Generation Sequencing, NGS)，大幅提升了基因體研究的深度與廣度，使研究人員能以快速、高通量且高解析度的方式，分析基因序列變異、基因表現、表觀遺傳修飾、免疫體學及微生物體等多層次生物資訊，為基礎生命科學研究、疾病機制探討及精準醫療發展帶來革命性的突破。

近年來，空間基因體學 (Spatial Genomics) 與空間多體學 (Spatial Omics) 技術的興起，更進一步突破傳統定序僅能獲得分子資訊的限制，透過保留組織空間位置資訊，同時解析基因表現、細胞組成及細胞間交互作用，使研究人員能深入了解腫瘤微環境、神經科學、發育生物學、免疫學及感染疾病等複雜生物系統，開啟生命科學研究的新里程碑。

本核心實驗室致力於建構完整且先進的基因體學、轉錄體學、表觀基因體學、空間基因體學及多體學分析平台，整合高通量定序、生物資訊分析與系統生物學研究策略，提供從實驗設計、樣本處理、定序分析到資料解析的一站式技術服務。藉由持續導入國際最新定序技術與分析流程，協助研究團隊深入探討疾病發生機制、生物標誌物發掘及治療反應評估，並推動基礎研究成果轉譯至臨床應用，期望在疾病早期診斷、治療前評估、療效監測、預後分析及精準醫療發展上持續貢獻，成為國內外生命科學與生醫研究的重要技術支援平台。

設置宗旨

• 建立臺灣本土基因體與空間基因體學 (Spatial Genomics) 數據資料庫，整合多體學資訊，作為疾病研究與精準醫療的重要基礎資源。

• 建立生物特徵 (Biosignatures)，結合基因體、轉錄體及空間多體學分析，發掘疾病早期診斷、預後評估及治療反應預測之生物標誌。
• 找尋並驗證新穎分子標的 (Molecular Targets)，解析疾病發生機制與腫瘤微環境，促進癌症精準治療、新藥開發及轉譯醫學研究。
• 建立並持續開發次世代定序 (Next Generation Sequencing, NGS)、第三代定序 (Third Generation Sequencing, TGS)、單細胞定序 (Single-cell Sequencing) 與空間基因體學 (Spatial Genomics) 等先進技術平台，推動其於健康醫療、疾病診斷及生命科學研究之應用。
• 整合高通量定序、生物資訊分析與系統生物學研究能量，提供完整的技術服務與分析流程，支援跨領域研究合作。
• 持續精進創新技術平台，深化產學合作，培育基因體學、空間多體學及生物資訊分析等跨領域專業人才，提升臺灣生醫研究與精準醫療之國際競爭力。

核心技術

DNA 定序平台 (DNA Sequencing)
• 全基因體定序 (Whole Genome Sequencing, WGS)
• 全外顯子體定序 (Whole Exome Sequencing, WES)
• FFPE 全外顯子體定序 (FFPE Whole Exome Sequencing)

RNA 定序平台 (RNA Sequencing)

• Poly(A) RNA 定序 (Poly(A) RNA Sequencing)
• 去核醣體 RNA 定序 (Ribominus RNA Sequencing)
• RNA Exome 定序 (Capture-based RNA Sequencing)
• 小 RNA 定序 (Small RNA Sequencing)
• 外泌體 RNA 定序 (Exosomal RNA Sequencing)

微生物與免疫體定序 (Microbiome & Immune Profiling)
• 微生物相 16S 定序 (Microbiome 16S Sequencing)
• T 細胞受體免疫譜定序 (TCR Repertoire Sequencing)

空間體學平台 (Spatial Omics)
• Visium Spatial Gene Expression 空間轉錄體分析
• Visium HD Spatial Gene Expression 高解析空間轉錄體分析
• Xenium Prime In Situ Gene Expression 原位空間基因表現分析

樣本前處理與品質分析
• 細胞／組織 DNA、RNA 萃取
• 外泌體 RNA 萃取 (Exosomal RNA Extraction)
• FFPE DNA、RNA 萃取
• 核酸品質分析 (Nucleic Acid QC)
• Library 品質分析 (Library QC)

聯絡方式

貴重及共同儀器中心基因體核酸分析平台
聯絡人：鍾成侑 博士
電話：03-2118800 ext: 3469
位置：長庚大學 第一醫學大樓九樓 A 區 分子醫學中心
E-mail: ngsbasespace@gmail.com

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