1. 運用現代科學方法，探討中醫學理論的思維。

2. 專注中醫臨床觀察與研究，提升研究生發揮中醫藥優勢。

3. 研究生對重要疾病問題及基礎領域的學習，藉以培育傑出學術研究人才，為人類健康做最優值的貢獻。

4. 本系教師研究能量佳並榮獲多項獎項肯定，如列入全球前2%頂尖科學家、中醫藥發展獎勵玉階獎--卓越貢獻獎、王民寧獎、國科會優秀年輕學者研究計畫補助、國家新創獎、優良教師輔導、教學、研究獎等。

5. 提供百分百學校住宿，優渥獎助學金，除申請教學助理外，另每月6000元以上研究獎助學金。

6. 鼓勵大學部學生修習學碩士學程，碩士生可申請逕行修讀博士班。