微型核醣核酸核心實驗室
發布日期:2024/07/23
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經由教育部頂尖大學計畫及長庚體系生物標識計畫規劃下,起初因應需在少量臨床樣本中同時檢測多個 microRNA (multiplex RT-qPCR),克服檢體中不同干擾物質如Heparin的影響,以及大量檢體上機需求,miRNA&qPCR檢測技術平台已完整且穩定的建立於大學分醫中心內,主要技術包括:臨床檢體前處理流程、不同種類樣品之RNA純化、Primer/Probe設計、檢體批量上機穩定性測試、臨床檢體上機標準化流程以及專門生物統計分析流程等,均已優化完成並主要提供生物標識所有計畫以及院內CMRP計畫使用。
在生物標識計畫中,microRNA平台主要是針對各項疾病 (已執行OSCC-I、CRC、AKI、CKD and AMI projects) 的臨床檢體,包括: plasma、urine、saliva、tissue以及stool samples,與正常對照組檢體進行比較,找出在特定疾病中有差異表現之microRNA,進行獨立樣本驗證與分析,最終找出能夠作為疾病檢測與評估之生物標識組合。根據過去經驗發現microRNA非常穩定存在各種臨床檢體中,未來有極高潛力轉譯作為疾病檢測之分子標的。本平台的主要實驗研究流程 (如圖所示),係利用定量聚合酶連鎖反應原理 (qPCR),在各項疾病臨床檢體中,依據先前實驗結果與參考文獻整理,挑選出有潛力作為檢測標的之microRNA,進行完整臨床檢體之驗證。至目前為止,此平台已完成超過4,300個生物標識計畫臨床檢體,為此計畫使用率最高的平台之一。
建立及維護microRNA 核心實驗設施、開發及應用microRNA平台,支援相關研究計畫。
聯絡方式
電話:03-2118800 ext: 3530
位置:長庚大學 第一醫學大樓九樓A區 分子醫學中心
E-mail:kaichi@mail.cgu.edu.tw
(內部信請寄到 分子醫學中心微型核醣核酸核心實驗室)
成員
設備
7500-HT快速實時PCR系統
7500-HT Fast Real-time PCR系統是是一種高通量實時PCR系統,可檢測和定量核酸序列。
7900-HT快速實時PCR系統
7900 HT Fast Real-time系統是一種高通量實時PCR系統,可檢測和定量核酸序列。
Agilent 2100 Bioanalyzer 微流體電泳分析儀
提供 DNA、RNA、蛋白質及細胞的片段大小、定性與定量等分析,只需在同一個平台下即可讓您獲得最佳品質的電泳數位數據。
Nanodrop 3300-超微量螢光定量光譜儀
全波長螢光光譜偵測儀,只需要1~2 μl 即可得到全波長光譜(emission 400-750nm)。
Proflex聚合酶連鎖反應器
具有獨立控制的加熱槽,可同時進行三個不同的實驗,快速又精準的升降溫控,有效減少非專一性產物。
QIAgility自動化液體處理系統
QIAgility 是一台結構緊湊的桌面自動化設備,專為自動化的PCR 體系構建而設計,它可為各類PCR 、定量PCR 反應系統。
QIAgility 高度的精確性讓您的定量PCR 檢測實驗結果具有最高的重複性,讓不同人員的操作或即使是不同實驗室之間亦具有高度的可比性。
自動化的PCR 體系設置快速而可靠,消除了人為加樣的誤差及可能發生的錯誤。高度的應用廣泛性使其得以相容幾乎所有類型的試管、微孔板,快速地自動化構建PCR體系,具有高度的精確性。
QuantStudio 12K Flex實時PCR系統
此系統將qPCR提升到一個新的水平,在普通PCR的基礎上,提高了通量與靈活性以及可擴展性,可在單一平臺上實現從靶點探索到驗證和篩選的全方位任務。
Qubit 2.0 螢光定量儀
採用專門研製的螢光檢測技術,該技術採用只有與DNA、RNA或蛋白質結合後才發出螢光的Molecular Probes 染料。這些螢光染料只有與特異性的靶分子結合時,才能發出螢光信號,即使有遊離核苷酸或降解核酸存在時亦是如此。
由於Qubit技術只檢測靶分子(而不是污染物)的濃度,因此這種特異性可以使您獲得十分精確的結果。即便對於低濃度樣品,Qubit螢光定量亦具有出眾的DNA 和RNA 定量特異性和靈敏度。