成立緣起
高通量(high-throughput)生物實驗技術揭開後基因體世代的序幕,而近十年來呈現突破性發展的次世代定序(Next Generation Sequencing;NGS)技術,讓研究人員可以快速且高通量的檢測出樣本中基因序列上的變異、基因表現量的差異與各種表觀基因組的變異等等,為基礎與臨床生命科學研究及精準醫療發展領域,均創造極佳的契機。本核心實驗室建構並研發最新的各種基因體學、轉錄體學及系統生物學研究策略與實驗平台,對臺灣數種特有的疾病做大規模系統性的研究,希望未來在疾病的早期診斷、治療前評估、治療後續追踪及精準醫療的目標願景貢獻一份心力。
 
設置宗旨
  1. 建立台灣本土癌症基因體組學數據資料庫
  2. 建立生物識別特徵(Biosignature),作為疾病早期診斷及預後評估的指標
  3. 找尋並評估新穎的分子標的(Molecular target),作為癌症精準治療及研發抗癌藥物的應用
  4. 建立並開發各項NGS技術平台應用於健康醫療檢測
  5. 增進創新技術的平台研發,推動產學合作與培育優秀人才。
核心技術
DNA測序平台
  1. 全外顯子組測序(Whole exome sequencing)
  2. DNA甲基化測序 (Methylation sequencing)
  3. 標的基因測序 (Targeted re-sequencing)
  4. 細菌16S測序(Bacterial 16S sequencing)
  5. 染色質免疫沉澱測序 (CHIP sequencing)
  6. 細胞外游離DNA測序 (cfDNA target sequencing)
RNA測序平台
  1. polyA RNA sequencing
  2. 核醣體RNA測序( Ribominus RNA sequencing)
  3. coding RNA sequencing (capture-based RNA sequencing)
  4. 微小RNA測序(Small RNA sequencing)
  5. 外吐小體微小RNA測序 (exosome small RNA sequencing)
  6. 免疫譜測序 (Immune repertoire sequencing)
  7. 單細胞轉錄體測序 (Single cell RNA sequencing)
聯絡方式
聯絡人:鍾成侑 博士
電話:03-2118800 ext: 3469、5529
位置:長庚大學 第一醫學大樓九樓A區 分子醫學中心
E-mail: ngsbasespace@gmail.com
(內部信請寄到 分子醫學中心次世代定序基因體核心實驗室)

設備

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焦磷酸測序儀


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Ion Proton™ 次世代定序儀


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Ion PGM™ 次世代定序儀


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MiSeq 次世代定序儀



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NextSeq 500次世代定序儀




超音波DNA破碎儀ImgDesc



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密閉式超音波核酸斷裂器



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離心管柱基因自動純化破碎系統


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微量分光光度計



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微流體電泳影像分析系統



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7500-HT快速實時PCR系統
7500-HT Fast Real-time PCR系統是是一種高通量實時PCR系統,可檢測和定量核酸序列。



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Qubit 2.0 螢光定量儀

採用專門研製的螢光檢測技術,該技術採用只有與DNA、RNA或蛋白質結合後才發出螢光的Molecular Probes 染料。這些螢光染料只有與特異性的靶分子結合時,才能發出螢光信號,即使有遊離核苷酸或降解核酸存在時亦是如此。
由於Qubit技術只檢測靶分子(而不是污染物)的濃度,因此這種特異性可以使您獲得十分精確的結果。即便對於低濃度樣品,Qubit螢光定量亦具有出眾的DNA 和RNA 定量特異性和靈敏度。
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Agilent 2100 Bioanalyzer 微流體電泳分析儀

提供 DNA、RNA、蛋白質及細胞的片段大小、定性與定量等分析,只需在同一個平台下即可讓您獲得最佳品質的電泳數位數據。